Флаг Пущина Московской области

Город Пущино Московской области расположен к югу от Москвы, на правом берегу реки Ока, является одним из научных центров Российской академии наук. В городе Пущино находится девять научно-исследовательских институтов, а также Пущинский биологический научный центр. Современный город получил название от деревни Пущино, которая находится на его северо-западной окраине и впервые упоминается в писцовых книгах времён Ивана Грозного как поместье рода Пущиных. XVIII—XIX вв. на берегу Оки возникла дворянская усадьба Пущино-на-Оке.

Флаг города Пущино Московской области был утвержден 12 июля 1999 года и внесен в ГГР РФ за номером 499. Прямоугольное полотнище, состоящее из двух горизонтальных неравнозначных полос: верхней – синей, нижней – красной. В верхней части расположены три восьмиконечных звезды. В красном поле изображен зеленый трилистник с белой окантовкой.

 Белые звёзды символизируют радиоастрономическую обсерваторию Физического института им. П. Н. Лебедева, расположенную в городе. Трилистник символизирует былой статус города, как центра биологических исследований АН СССР.  Синий цвет  символизирует природу Подмосковья, реку Оку, а также честь, красота и добродетель. Белый цвет - простота, совершенство, мудрость, благородство, мир. Красный цвет - жизнеутверждающая сила, энергия и красота.